براساس ماده 2 اساسنامه پایگاه استنادی علوم جهان اسلام مصوب 88.2.31) وظایف مرتبط با پایش و  ارزیابی، به صورت زیر بیان شده است:
- ثبت و ارزش‌گذاری کمی و کیفی و رتبه بندی مجلات و سایر تولیدات علمی در زیرمجموعه‌های پایگاه پس از طی مراحل علمی ارزیابی با تاکید بر شاخص های علم سنجی با لحاظ کردن جهان بینی اسلامی؛
- شناسایی اثربخش ترین آثار علمی در رشته های موضوعی مختلف؛

از اواخر دهه 80 در این پایگاه، سامانه های مختلفی در راستای وظایف ذکرشده برای آن،  راه اندازی شده است که از جمله آنها رتبه‌بندی مجلات و دانشگاه‌ها و موسسات پژوهشی است که براساس شاخصهای طراحی شده انجام می‌گیرد و پس از گردآوری داده‌ها مبادرت به تولید گزارش سالانه می نماید. آخرین گزارش آن مرتبط به رتبه بندی دانشگاه ها و موسسات پژوهشی ایران سال 94-1393 است. برخی از اهم شاخصهای معیار پژوهش عبارتند از: کیفیت پژوهش، کارایی پژوهش، حجم پژوهش، نرخ رشد کیفیت پژوهش، نرخ رشد کارایی پژوهش، و جوایز. البته لیست کامل شاخصها از طریق وب سایت این پایگاه قابل دستیابی است.
 لینک کل شاخصها: http://ur.isc.gov.ir/Methodology.aspx